甲硝唑治疗阿米巴病的效果通常较好，尤其适用于肠道和肠外阿米巴感染的治疗。其疗效主要取决于感染部位、病情严重程度以及患者个体差异，需在医生指导下规范使用。
甲硝唑可通过抑制阿米巴原虫的DNA合成，干扰其代谢过程，从而有效杀灭组织内的滋养体。对于急性阿米巴痢疾，该药能快速缓解腹泻、腹痛及血便等症状。针对阿米巴肝脓肿等肠外感染，甲硝唑可穿透脓肿壁发挥杀菌作用，常需联合穿刺引流等治疗。但需注意，部分虫株可能对甲硝唑产生耐药性，此时需调整用药方案。
治疗期间应严格遵医嘱完成疗程，避免擅自停药导致复发。用药期间可能出现恶心、头痛等不良反应，通常不影响继续治疗。孕妇及哺乳期妇女需慎用，用药期间及停药后3日内应禁止饮酒。若治疗3-5天后症状无改善，应及时复诊评估是否需要更换克林霉素等其他抗阿米巴药物。