他克莫司长期使用可能对生育功能产生一定影响，但存在性别差异和个体差异，通常需结合具体情况评估。目前研究显示其对生殖系统的影响多数为可逆性，停药后可逐渐恢复。
男性长期使用他克莫司可能抑制睾丸生精功能，导致精子数量减少或活力下降。这种抑制作用与药物剂量和治疗时长相关，动物实验显示高剂量给药会影响精子生成。但在临床观察中，多数患者在调整剂量或停药3-6个月后精液参数可改善。女性患者长期用药可能干扰下丘脑-垂体-卵巢轴，表现为月经周期紊乱或排卵异常。研究数据显示约15%-20%的育龄期女性用药期间出现月经不调，但未发现致畸性证据。
建议有生育需求的患者提前3-6个月与主治医生沟通，进行生殖功能评估和药物调整。用药期间需严格避孕，避免药物对生殖细胞的潜在影响。若已怀孕或计划怀孕，需在医生指导下进行血药浓度监测和剂量优化，目前临床指南指出在充分评估获益风险后，部分患者可在严密监护下继续用药。