番茄通常有助于促进消化，但其具体效果可能因个体情况而异。番茄含有多种有益成分，适量食用对消化系统有一定的积极作用。
番茄中富含膳食纤维，尤其是果胶成分，这类不可溶性纤维能增加粪便体积，刺激肠道蠕动。其所含的柠檬酸、苹果酸等有机酸能促进胃酸分泌，帮助分解蛋白质类食物。研究显示番茄红素具有抗氧化特性，可能间接维护消化道黏膜健康。对于胃酸分泌不足引起的消化不良，适量食用可改善餐后饱胀感。
但需注意，胃食管反流患者应控制摄入量，因其酸性可能诱发反酸症状。肠易激综合征患者在腹泻发作期需减少生食。日常建议将番茄加热处理后食用，既能提高番茄红素吸收率，又能降低对胃肠道的刺激。存在慢性消化道疾病者，食用前应咨询消化科医师。