金枪鱼含有较为丰富的欧米茄3脂肪酸，属于深海鱼类中较为优质的来源之一。其含量受品种、部位及烹饪方式影响，适量食用可为人体提供一定营养支持。
欧米茄3脂肪酸主要包括DHA和EPA，对心血管健康、神经系统发育具有积极作用。金枪鱼的长链脂肪酸含量较高，尤其是鱼腹等脂肪较多的部位。与其他深海鱼相比，蓝鳍金枪鱼的EPA含量可达每100克鱼肉含1.5克左右，黄鳍金枪鱼含量略低。冷冻处理或油浸罐头会使部分脂肪酸流失，但仍是膳食补充的有效途径之一。
建议每周摄入2-3次深海鱼类，每次约100克。特殊人群如孕妇需注意选择汞含量较低的品种，并保持饮食多样性，避免单一食物过量摄入。若存在特殊营养需求，可在营养师指导下调整膳食结构。