阴茎毛囊炎与疱疹感染可通过病因、症状特征以及病程等方面进行区分。若无法自行辨别，建议及时到皮肤科或泌尿外科就诊，由医生明确诊断。
1、病因不同
阴茎毛囊炎主要由细菌感染引起，常见致病菌为金黄色葡萄球菌，多因局部卫生不良、毛囊损伤后感染所致。疱疹感染则由单纯疱疹病毒（HSV）引起，属于性传播疾病，通过皮肤黏膜接触传染。
2、症状特征不同
阴茎毛囊炎表现为单个或多个红色丘疹或脓疱，中心可见毛发穿出，伴有明显触痛或按压痛，脓疱破溃后可能流出脓液。疱疹感染初期为群集性小水疱，疱液清亮，周围皮肤发红，水疱易破溃形成浅表糜烂或溃疡，常伴有灼热、瘙痒或针刺样神经痛。
3、病程与复发情况不同
毛囊炎病程较短，经抗感染治疗约1周可消退，愈后通常不遗留瘢痕。疱疹感染具有复发性，初次发作后病毒可潜伏于神经节，在免疫力下降时再次激活，表现为同一部位反复出现水疱，部分患者可能伴随发热、淋巴结肿大等全身症状。
若阴茎皮肤出现异常皮损，建议避免搔抓或自行挤破皮损，以免加重感染。医生可通过HSV抗原检测、细菌培养或PCR检查明确病原体类型，并针对性给予抗生素或抗病毒药物治疗。日常需保持局部清洁干燥，避免不洁性行为。