避孕套的有效性主要基于其物理阻隔特性，能显著降低性传播疾病风险。正确使用的前提下，一般可通过以下五方面机制发挥预防作用：
1、物理屏障阻隔
避孕套作为乳胶或聚氨酯材质的屏障，可覆盖阴茎或插入性器具表面，直接阻隔皮肤溃损部位、黏膜与病原体的接触路径，避免疱疹、梅毒等通过皮肤接触传播的疾病感染。
2、阻断体液交换
精液、阴道分泌物中的HIV、淋球菌、衣原体等病原体无法穿透避孕套材质，能有效防止含有病毒的体液进入对方生殖道或血液循环系统，降低血液传播疾病概率达85%以上。
3、限制病原体传播
直径大于避孕套材料孔隙的病原体（如乙肝病毒、HPV病毒）会被阻隔在外。实验数据显示，持续正确使用避孕套可使HIV传播风险降低约80%-95%。
4、减少黏膜损伤
润滑型避孕套能降低性行为过程中的摩擦损伤，维持生殖道黏膜完整性。完整的黏膜上皮可增强局部免疫力，减少病原体入侵的突破口。
5、正确使用保障
从撕开包装到佩戴过程规范操作，能确保避孕套无破损滑脱。研究证实，规范使用可使避孕套破裂率低于0.6%，而随意使用破裂率可达7%-14%。
使用前需检查有效期及完整性，佩戴时捏住储精囊排出空气。需注意避孕套无法覆盖所有易感区域（如阴囊、会阴部），对HPV等病毒防护存在局限性，建议结合定期体检等综合防护措施。