肠镜检查是否会引起疼痛因人而异，通常与检查方式和个人体质有关。多数情况下可能出现轻微不适，但一般可以耐受。
肠镜检查分为普通肠镜和无痛肠镜两种类型。无痛肠镜通过静脉注射麻醉药物使受检者处于睡眠状态，过程中不会感知疼痛。普通肠镜在清醒状态下进行，检查时肠镜通过肠道弯曲处可能引起胀痛或牵拉感，但疼痛程度多为轻度至中度。肠道结构异常如存在粘连或狭窄，可能增加操作难度并加重不适感。对疼痛敏感的人群可能对肠腔充气引起的腹胀感更为敏感。
检查前严格遵循清肠准备能减少操作时间，配合医生指令调整体位有助于减轻不适。精神过度紧张可能放大疼痛感知，检查前可通过深呼吸放松。若在检查过程中出现剧烈疼痛，需立即告知操作医生停止进镜。建议根据自身耐受度选择检查方式，无痛肠镜适合恐惧疼痛或肠道结构复杂者。