染色体Y异常可能会对生育能力产生影响，但具体情况需根据异常类型和严重程度综合判断。部分患者可能表现为精子生成障碍或精子质量下降，但并非所有异常都会导致绝对不育。
1、AZF区域微缺失
Y染色体长臂的AZF区域微缺失是常见异常类型，可能影响生精功能。例如AZFc区缺失患者可能表现为少精子症，仍可通过辅助生殖技术如卵胞浆内单精子注射（ICSI）获得后代，但AZFa或AZFb区完全缺失时，睾丸中可能完全无精子生成。
2、染色体结构异常
Y染色体存在倒位、环状染色体等结构异常时，可能干扰减数分裂过程，导致精子DNA碎片率增高。这种情况下即使能自然受孕，也可能增加胚胎停育或流产风险，建议进行胚胎植入前遗传学检测（PGT）筛选正常胚胎。
3、嵌合型异常
约5%-10%的病例属于嵌合型Y染色体异常，此类患者睾丸中可能同时存在正常和异常细胞系。通过睾丸显微取精术（micro-TESE）获取精子的成功率可达30%-40%，但需注意获得的精子可能存在遗传异常，需在生殖医学中心进行详细遗传咨询。
存在Y染色体异常的男性计划生育时，建议进行精液分析、性激素检测和遗传学评估。随着辅助生殖技术的发展，约50%-60%的患者可通过显微取精联合ICSI技术获得生物学后代，但子代男性存在遗传相同异常的风险，需在专业生殖遗传医师指导下制定生育策略。