小便发黄伴随疼痛可能是生理性原因所致，也可能与尿路感染、尿路结石等疾病原因有关，建议及时就诊查明病因。
1、生理性原因
若近期饮水不足或大量出汗，可能导致尿液浓缩，出现小便颜色加深、排尿时轻微灼热感。此时通常无其他明显不适，适当增加饮水量后症状可逐渐缓解，无需特殊治疗。
2、尿路感染
细菌感染尿道、膀胱等部位时，可能出现尿频、尿急、尿痛及尿液浑浊发黄。严重时可能出现血尿或发热。治疗时可遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星片、头孢克肟胶囊、三金片等药物控制感染，同时需多喝水促进排尿。
3、尿路结石
肾结石或输尿管结石移动可能划伤尿路黏膜，引发腰腹部绞痛、血尿及排尿刺痛。尿液因含血液或结晶物质可呈深黄色或褐色。确诊后可通过服用排石颗粒、双氯芬酸钠缓释片缓解症状，较大结石需体外冲击波碎石或手术取石。
若调整饮水后症状未改善，或伴有发热、腰痛等情况，建议及时到泌尿外科就诊，完善尿常规、超声等检查。日常需保持每日饮水量在1500-2000ml，避免憋尿，注意个人卫生清洁以减少感染风险。