肛瘘患者就诊时通常需挂肛肠科、普通外科或结直肠肛门外科，具体可根据医院科室设置选择。部分医院分科较细，可优先选择肛肠科；若无专门科室，可选择普通外科。若为儿童患者，还可考虑小儿外科。
肛瘘是肛管直肠与皮肤间形成的异常通道，常由肛周脓肿发展而来。肛肠科专门诊治肛门、直肠及结直肠疾病，医生具备丰富的肛瘘诊疗经验，可进行专科查体、肛门指检及肛镜等检查。普通外科涵盖范围较广，包括各类体表感染、脓肿及肛肠疾病，也可处理肛瘘问题。结直肠肛门外科则更专注于结直肠及肛门区域的外科疾病，适合需要手术治疗的复杂肛瘘患者。
就诊前可通过医院官网或电话咨询科室设置，部分医院导诊台也可提供帮助。确诊肛瘘后应尽早治疗，避免反复感染导致病情加重。日常注意保持肛周清洁，避免久坐及辛辣饮食，促进恢复。