核磁共振一般可以检查中枢神经系统疾病、骨关节疾病、腹部疾病、心血管疾病以及盆腔疾病等，具体需根据病情由医生综合判断。该检查具有无辐射、高分辨率等优势，能够清晰显示软组织病变。
1、中枢神经系统疾病
核磁共振对脑部及脊髓病变的检测尤为敏感，可清晰显示脑梗死、脑肿瘤、脑出血等病变。其多序列成像特点能区分急性期与慢性期脑梗死，帮助判断脑肿瘤的良恶性。对于脊髓炎、椎管内肿瘤或椎间盘突出压迫神经的情况，也能通过矢状位成像明确病变范围。
2、骨关节疾病
该检查能有效评估软骨损伤、半月板撕裂、韧带断裂等关节结构异常。相较于X线或CT，核磁共振可三维立体显示关节腔积液、滑膜炎性改变以及隐匿性骨折。对于早期股骨头坏死、骨肿瘤浸润范围的判断具有重要价值。
3、腹部疾病
通过多参数成像技术，可检测肝脏血管瘤、肝癌、胰腺炎等病变。动态增强扫描能鉴别肝硬化结节与恶性肿瘤，磁共振胰胆管成像（MRCP）无需造影剂即可显示胆道梗阻部位。对于肾脏占位性病变的良恶性鉴别也有较高准确性。
4、心血管疾病
心脏磁共振能评估心肌梗死范围、心肌病的心肌纤维化程度以及心脏瓣膜功能。血管成像可显示主动脉夹层、动脉瘤等血管病变，无创检测冠状动脉畸形或心肌灌注异常。
5、盆腔疾病
适用于前列腺癌、子宫肌瘤、卵巢肿瘤等疾病的检测，能清晰显示肿瘤与周围组织的解剖关系。对于直肠癌术前分期、子宫内膜异位症病灶定位具有重要临床意义。
需注意体内有心脏起搏器、金属植入物或幽闭恐惧症患者不宜进行此项检查。具体检查项目需由临床医生根据症状、体征及其他辅助检查结果综合判断，患者不可自行要求进行不必要的影像学检查。