硫化硒在正确使用的情况下一般不会对人体造成明显伤害，但若使用不当可能引发皮肤刺激或其他不良反应。其安全性主要取决于浓度、使用方式以及个体差异。
硫化硒作为药用成分时，通常以2.5%左右的浓度添加于洗剂中，用于治疗脂溢性皮炎或头皮屑。在医生指导下按说明书使用时，可抑制真菌生长并减少油脂分泌，此时对皮肤刺激性较低。若自行增加使用频率或误服该成分，可能引起局部灼热感、红斑，严重时可能出现脱发或消化道不适。部分人群对硒元素存在过敏反应，表现为瘙痒、水肿等接触性皮炎症状。
使用含硫化硒的产品前需进行皮肤敏感测试，避免接触眼睛及黏膜。孕妇、哺乳期女性及儿童群体应在医师评估后使用。若使用后出现持续红肿、疼痛或全身不适，应立即停用并用清水冲洗，及时前往皮肤科就诊检查。