山萸肉可能对慢性疲劳综合征有一定的辅助缓解作用，但无法单独治愈该疾病。慢性疲劳综合征的病因较为复杂，通常需要综合治疗。
山萸肉在中医理论中具有补益肝肾、收敛固脱的功效，常用于治疗肝肾不足引起的腰膝酸软、头晕耳鸣等症状。部分患者因体质虚弱出现疲劳症状时，适量使用山萸肉可能有助于改善体力状态。但现代医学认为慢性疲劳综合征涉及神经内分泌紊乱、免疫失调等多种机制，单纯依靠山萸肉难以全面调节机体功能。
需要注意的是，中医治疗强调辨证论治，不同证型的患者需配伍不同药材。如气阴两虚者常配伍人参、麦冬，阳虚者多配合附子、肉桂。慢性疲劳综合征患者若长期存在严重疲劳、睡眠障碍或认知功能下降等症状，应及时到正规医院进行系统检查，排除甲状腺功能异常、抑郁症等器质性疾病。日常应注意保持规律作息，适当进行有氧运动，必要时可在医生指导下采用中西医结合治疗方案。