卵圆孔未闭可能不会引起明显症状，部分患者可能出现偏头痛、隐源性脑卒中等表现，严重时可伴随肢体麻木或呼吸困难。该疾病多为胚胎发育异常所致，若未及时干预可能增加血栓风险。
卵圆孔未闭的症状通常与异常分流引起的并发症有关。部分患者会出现反复发作的偏头痛，尤其是伴随视觉先兆的偏头痛，可能与静脉系统微小血栓通过未闭合的卵圆孔进入脑部血管有关。中青年人群突发不明原因的脑卒中时，需考虑卵圆孔未闭导致反常栓塞的可能性。潜水员出现减压病时若存在卵圆孔未闭，气体栓子可能直接进入动脉系统引发肢体疼痛或感觉异常。少数患者可能出现活动后气促、血氧饱和度下降等症状，多见于存在右向左分流的病例。
存在上述症状的患者建议进行心脏超声检查，必要时可通过经食道心脏超声检查或右心声学造影明确诊断。治疗方面，医生会根据具体情况选择抗血小板药物、抗凝药物或介入封堵术。日常需避免剧烈咳嗽、屏气等可能增加右心压力的动作，潜水等高危活动前应接受专业评估。