香砂六君丸与归脾丸在功效、适用证及组方方面存在明显差异，二者均属于中成药但针对的证型不同。香砂六君丸侧重健脾行气化湿，归脾丸则偏重益气养血安神，需在中医辨证后使用。
1、功效与主治差异
香砂六君丸由木香、砂仁配伍六君子汤化裁而成，具有益气健脾、和胃化湿的功效，适用于脾胃气虚兼气滞湿阻引起的脘腹胀满、食欲不振、大便溏泄等症状。归脾丸以四君子汤为基础加入黄芪、当归、龙眼肉等药物，具有健脾养心、益气补血的功效，主要用于心脾两虚所致的气短心悸、失眠多梦、肢倦乏力及崩漏便血等症。
2、组方配伍差异
香砂六君丸在六君子汤（党参、白术、茯苓、甘草、半夏、陈皮）基础上增加木香、砂仁，强化了行气止痛、芳香化湿的作用。归脾丸除四君子汤外，配伍黄芪、当归补气生血，佐以远志、酸枣仁宁心安神，整体组方侧重气血双补。
3、适用症状差异
前者适用于以胃肠功能紊乱为主的病症，如慢性胃炎、功能性消化不良等表现为腹胀、嗳气、舌苔厚腻者。后者适用于神经衰弱、贫血、月经不调等属心脾两虚者，常见面色萎黄、健忘失眠、脉细弱等血虚征象。
建议在使用前由中医师通过望闻问切明确证型，避免自行用药。两种药物虽均含补气成分，但归脾丸偏温补，湿热内盛者慎用；香砂六君丸兼有理气功效，阴虚火旺者需慎用。具体用药方案应根据个体体质调整。